Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJA9P57773 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJA9P57773 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJA9P57773 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJA9P57773 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJA9P57773 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJA9P57773 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJA9P57773 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms