Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EEFSECP57772 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms