Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX17P56962 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX17P56962 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX17P56962 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STX17P56962 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms