Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP98P52948 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP98P52948 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP98P52948 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms