Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLK1P49759 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLK1P49759 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLK1P49759 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms