Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPGP40121 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPGP40121 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPGP40121 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPGP40121 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAPGP40121 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPGP40121 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPGP40121 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPGP40121 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CAPGP40121 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPGP40121 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPGP40121 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms