Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNCAP37840 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNCAP37840 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNCAP37840 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNCAP37840 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNCAP37840 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNCAP37840 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms