Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP62P37198 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms