Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms