Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXD12P35452 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms