Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms