Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BRS3P32247 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BRS3P32247 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms