Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXC12P31275 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC12P31275 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms