Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLD1P28340 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLD1P28340 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLD1P28340 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLD1P28340 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLD1P28340 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms