Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB4P28070 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB4P28070 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms