Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO1P25800 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO1P25800 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms