Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHCGRP22888 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHCGRP22888 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms