Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA1P20827 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms