Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDSP20132 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDSP20132 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDSP20132 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDSP20132 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDSP20132 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDSP20132 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms