Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNA6P17658 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNA6P17658 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms