Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSPT1P15170 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms