Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-DOBP13765 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms