Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG2P13521 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG2P13521 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG2P13521 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCG2P13521 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG2P13521 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG2P13521 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms