Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEFA4P12838 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEFA4P12838 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms