Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1P0DP58 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms