Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI1P08151 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI1P08151 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI1P08151 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI1P08151 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms