Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC3P02656 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms