Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSD2O96028 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSD2O96028 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSD2O96028 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSD2O96028 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSD2O96028 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSD2O96028 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSD2O96028 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSD2O96028 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSD2O96028 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms