Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms