Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX3O75364 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX3O75364 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX3O75364 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms