Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP2O75323 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms