Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTNBO60941 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTNBO60941 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms