Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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