Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CREB3O43889 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB3O43889 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB3O43889 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms