Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2O14595 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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