Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QLI3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QLI3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QLI3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QLI3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3QLI3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QLI3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QLI3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QLI3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3QLI3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3QLI3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QLI3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QLI3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QLI3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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