Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CROCC2H7BZ55 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms