Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms