Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C6orf229H3BNL8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms