Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1G3V0Z9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1G3V0Z9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1G3V0Z9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYNX1G3V0Z9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNX1G3V0Z9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms