Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4DLN1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4DLN1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DLN1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4DLN1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DLN1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DLN1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
B4DLN1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DLN1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms