Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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