Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SERINC4A6NH21 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SERINC4A6NH21 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms