Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms