Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms