Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144AA2RUR9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms