Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SPX-201ENST00000256969 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 GINS1-201ENST00000262460 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC112719.1-201ENST00000477971 315 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC048344.3-201ENST00000605512 251 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 PRKAG2-AS1-201ENST00000464464 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD11P31277 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC122688.4-201ENST00000623279 4394 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1063.9 ms