Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOV10L1-205ENST00000395858 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC13A3-210ENST00000472148 3283 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PABPC3-201ENST00000281589 3387 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RTL1-201ENST00000534062 4193 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA6A-201ENST00000257414 4256 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS22-218ENST00000617334 4253 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCY1A3-204ENST00000455639 2631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP004782.1-201ENST00000623990 3433 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 STRADA-226ENST00000638276 1865 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTO1-201ENST00000370300 2961 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPPE-201ENST00000342462 3962 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MERTK-202ENST00000409780 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP452-201ENST00000363004 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC131097.2-201ENST00000404031 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012363.2-201ENST00000437837 555 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099681.1-201ENST00000454777 552 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004706.2-201ENST00000576277 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004253.2-201ENST00000585025 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.169-201ENST00000613708 283 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01835-203ENST00000639800 567 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms