Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ5

KRTAP4-6, Keratin-associated protein 4-6, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF263-201ENST00000219069 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNU1-8P-201ENST00000384328 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 PIK3CG-202ENST00000440650 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RN7SL461P-201ENST00000484915 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AL031283.1-201ENST00000427824 5178 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 KCNMA1-246ENST00000638848 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 PCDHGB6-202ENST00000616430 4601 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 EBF3-202ENST00000368648 4375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 NPY2R-201ENST00000329476 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 DNM1P46-201ENST00000341853 3831 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ICA1L-222ENST00000617388 8151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CHRM3-207ENST00000615928 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TNC-211ENST00000537320 4946 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 ADGRG1-267ENST00000568909 4254 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 BBS1-201ENST00000318312 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-6Q9BYQ5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms