Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM9Q9Y5J7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms